Mega Man X3

洛克人X與其信賴的夥伴傑洛面臨全新威脅。在名為「多普拉鎮」的實驗性烏托邦中，是誰或什麼原因引發了非正規品暴動？這座以科學家型思考型機器人多普拉命名的城鎮，原本應是人類與思考型機器人和平共處的理想之地。在發現導致思考型機器人變成非正規品的病毒後，多普拉研發的抗病毒程式大獲成功。然而多普拉本身卻遭到病毒感染，並集結了一支隊伍企圖消滅非正規獵人部隊。多普拉效應即將展開，而洛克人X與傑洛正是對抗這致命病毒的唯一解藥！

回歸非正規獵人行列的傑洛，擔任了零特殊部隊的指揮官，並與活躍於第17精銳部隊指揮官的X，以及部隊中的其他獵人持續掃蕩非正規品。與此同時，科學家型思考型機器人多普拉博士進行研究，發現電腦病毒「西格瑪病毒」正是引發非正規化的原因，並開發出特殊的抗體病毒，提議將其注入思考型機器人體內。結果，非正規品的數量隨之減少。此外，多普拉博士宣布將建造人類與思考型機器人能和平共處的和平城市「多普拉鎮」，獲得了人類與思考型機器人雙方的支持。然而數個月後，接觸上述抗體病毒的多普拉及其旗下的思考型機器人卻發動了叛亂。非正規獵人認定多普拉及參與叛亂者為非正規品，並命令X與傑洛出動執行任務。